福船以樟木和杉木为材料，并备有水密隔舱。内舱用横梁和木板隔成三层，横梁比传统中国船要多;甲板下第一层则是无横向隔间的统舱，计划用来放置大炮或货物;底舱保留中国船的水密隔舱设计。除此之外，需注意后隔舱板与加强材夹角处的填缝胶。北宋后期奉使高丽的大型远洋船队开辟“放洋”航线，一个基本条件就是建造采用水密隔舱技术的大型海船，保障航海安全。目前发现的船体构件，有龙骨、桅座、隔舱壁板、船底板、甲板、护舷木等。由于船壳破损，海水进入甲板下左舷水密隔舱，使驳船失去平衡，最终导致了货轮及所载货物一起翻沉。除还在进行一些上层建筑工作外，结构方面的工作已全部完成，内部水密隔舱已全部焊入。 