既然慢生根瘤菌也会生成根瘤从而建立共生关系，它们一定使用了不同的信号分子来实现这个目的。根瘤菌已经帮助了数种重要的豆科植物在缺氮的土壤上生长，这包括花生、豌豆、小扁豆和大豆，以及角豆树与合欢树。勿庸置疑，今后的研究应该进一步认识根瘤菌和植物双方基因的特征。豆类被根瘤菌和博斯特属菌感染的过程分为几步。豆科植物的根际比非豆科植物的根际或离根土壤更能刺激根瘤菌的生长。采用裂区设计法研究了重庆缙云山酸性土上施钙与接种耐酸根瘤菌对紫花苜蓿生长和品质的影响。而且，不同的根瘤菌中这种共生关系和固氮能力明显不同。对氮处理若能接种则更好，这样就进一步明确增产中超过足量根瘤菌可获得产量水平以上的是矿质氮素的作用。根瘤菌的主要侵入点是植物的根须。除了豆科根瘤菌之外，用其他微生物接种剂改善作物营养还没有被广为应用。 